Sebagai kegiatan yang dilaksanakan setiap tahun, LPPMPHP berpartisipasi langsung pada Rakernis yang diwakili oleh Plt Kepala LPPMPHP dan Koordinator TO. Rapat Kerja Teknis memiliki peran strategis untuk merencanakan dan mengoreksi kembali tingkat kemajuan rangkaian program yang telah dilaksanakan di lingkup KKP. Rapat Kerja Teknis Lingkup KKP yang dilaksanakan di Ballroom, Gedung Mina Bahari III, pada tanggal 30 Mei 2016 dibuka oleh Menteri Kelautan dan Perikanan Susi Pudjiastuti dan dihadiri sekitar 600 peserta dari perwakilan Unit Pelaksanan Teknis (UPT) lingkup KKP serta Dinas Provinsi dan Kab/Kota seluruh Indonesia. Dalam Rakernis ini juga di launching program Satu Data sebagai program unggulan KKP untuk mendukung kebijakan nasional sebagai wujud peningkatan kualitas data, penyatuan data, dan pembukaan akses data bagi masyarakat luas. Rakernis 2016 terbagi dalam empat sesi yang menghadirkan narasumber Setjen KKP, perwakilan dari Kenterian Keuangan, Bappenas dan Kementerian Dalam Negeri, perwakilan dari Kementerian Pekerjaan Umum dan Perumahan Rakyat (PUPR) dan Kementerian Koperasi dan UKM, dan perwakilan PT Pertamina dan Perindo.
Selain menghadiri kegiatan Rakernis 2016 lingkup KKP, perwakilan LPPMPHP juga menghadiri kegiatan Rakernis lingkup BalitbangKP di hotel Royal Bogor pada tanggal 30 Mei – 1 Juni 2016 dengan tema “Reposisi peran Balitbang KP dalam pembangunan Kelautan dan Perikanan ke depan”. Rangkaian kegiatan dimulai dengan pembukaan oleh Kepala Badan Litbang KP yaitu Bapak Muhamad Zulficar Mochtar. Sekaligus memberikan arahan kepada seluruh peserta Rakernis. Dalam arahannya Kepala Balitbang menyatakan bahwa program-program kegiatan Balitbang KP harus berubah dari kegiatan penelitian yang tak berujung menjadi in house consultant Dirjen Teknis dan Pusat Inovasi terhadap isu-isu strategis yang mengemuka saat ini di bidang kelautan dan perikanan. Selanjutnya kegiatan dibagi menjadi 3 sidang kelompok yaitu : 1. Kelembagaan dan sarana prasarana, 2. Penelitian dan pengembangan serta 3. Diseminasi. Output yang diharapkan dari penyelenggaraan meliputi rekomendasi reposisi lembaga Litbang sebagai pusat kepakaran, rekomendasi fokus roadmap penelitian terdepan, dan rekomendasi strategi komunikasi hasil riset yang selanjutnya akan dituangkan dalam sebuah rumusan sebagai acuan kegiatan Balitbang KP kedepan.